BIO-RAD QX200™ AutoDG™ Droplet Digital™ PCR System
AutoDG sustav se kao i QX200™ Droplet Digital™ PCR sustav se sastoji od dva instrumenta, samo što umjesto QX200 droplet generatora ima automatizirani droplet generator uz to ima QX200 droplet čitač te uz to ide i potrošni materijal koji je dio sustava.
Prednosti AutoDG nad QX200 droplet generatorom su pojednostavljeni ddPCR protokol, veća procesivnost (jedan AutoDG može kontinuirano opsluživati 4-5 QX200 droplet readera), te eliminacija ljudske pogreške tijekom pipetiranja što rezultira konzistentnijim rezultatima. Također treba napomenuti da se smanjuje i mogućnost kontaminacije uzoraka jer AutoDG reducira hands-on time i ima HEPA-filtriran zatvoren prostor.
QX200™ AutoDG™ Droplet Digital™ PCR (ddPCR™) sustav omogućava apsolutnu kvantifikaciju ciljnih DNA ili RNA molekula za EvaGreen ili na probama baziranim digitalnim PCR aplikacijama.
AutoDG se koristi da odijeli ddPCR reakcijsku mješavinu u tisuće dropleta nanolitarskih dimenzija. Nakon PCR reakcije u termalnom cycleru, dropleti iz svakog uzorka se individualno analiziraju na QX200 čitaču. Dropleti se čitaju jažicu po jažicu tako da dropleti jedan po jedan u seriji prolaze kraj dvobojnog optičkog detekcijskog sustava. U jednoj vožnji može biti obrađeno 96 uzoraka. Kako bi se dobila apsolutna kvantifikacija ciljne DNA broje se PCR pozitivni i PCR negativni dropleti, kao rezultat dobijemo broj kopija te broj kopija po 1µl (cpm). Amplificirani produkti se mogu po potrebi i ekstrahirati iz dropleta za potrebe PCR nizvodnih aplikacija kao što su sekvenciranje ili kloniranje. Operativni raspon detekcije ddPCR sustava je 0.24-5000 cpm/well.
Aplikacija QX200™ AutoDG™ Droplet Digital™ PCR (ddPCR™) sustava
Studije tumorskih bio markera i varijacija broja kopija (CNV)
Mjerenje različitih stupnjeva tumorskih mutacija, detekcija rijetkih kopija ciljne DNA, analiza varijacije broja kopija uz do sad neviđenu razlučivost i osjetljivost. Dostupni su i unaprijed osmišljeni te laboratorijski validirani testovi za detekciju mutacija i detekciju broja kopija.
Detekcija patogena
Zahvaljujući vrhunskoj preciznosti i razlučivosti QX200™ AutoDG™ sustav može kvantificirati male promjene količine ciljnih DNA ili RNA molekula u cilju detekcije i nadzora patogena .
Sekvenciranje slijedeće generacije (NGS)
Izvedite preciznu kvantifikaciju i kvalifikaciju NGS knjižnica bez upotrebe standardne krivulje.
Analize genske ekspresije
Postignite pouzdane i ponovljive rezultate malih promjena u količini malih količina mRNA i miRNA
Nadzor okoliša
Testirajte širok spektar okolišnih uzoraka kao što su tlo ili voda uz puno nižu razinu detekcije i puno veću rezoluciju nego do sada.
Testiranje hrane
Izvodite rutinski nadzor genetski modificiranih organizama (GMO) koristeći validirane ddPCR metode.
Dodatni instrumenti
QX200™ AutoDG™ droplet digitalni PCR sustav zahtjeva i upotrebu 96 deep well thermal cyclera kao što je npr. C1000 Touch™ Thermal Cycler with 96–Deep Well Reaction Module i PX1™ PCR Plate Sealer kako bi se osigurali da tijekom PCR reakcije ne bismo imali probleme sa isparavanjem uzoraka.
Potrebni dodatni materijali
DG32™ Cartridges for AutoDG – potrošni materijal koji se koristi u automatskom droplet generatoru kako bi se ddPCR mix odijelio u otprilike 20 tisuća nanolitarskih dropleta (točan volumen dropleta je 0.91nl).
Ulje za automatizirano generiranje dropleta za probe
Ulje za automatizirano generiranje dropleta za EvaGreen
Tipsevi za AutoDG pipetu
AutoDG košara za iskorištene tipseve
Ulje za droplet reader
Specifikacije:
Startna veličina uzorka, µl |
20 |
kapacitet automatiziranog droplet generatora |
1-96 uzoraka/vožnji |
Dropleta po 20 µl uzorku |
20000 |
kapacitet QX200 droplet čitača |
1-96 uzoraka |
Osvjetljenje uzorka |
LED |
Detekcija uzorka |
Više-pikselni fotonski brojač |
Detekcijski kanali |
FAM (EvaGreen), HEX (VIC) |
Linearni dinamički raspon |
5 redova veličine |
Preciznost |
±10% |
Dropleta po pločici sa 96 jažica, miliona |
~1.5 |
Dimenzije automatiziranog droplet generatora (ŠxDxV) |
Otvoren:66 x 56 x 89 cm Zatvoren:66 x 56 x 66 cm |
Dimenzije QX200 droplet čitača (ŠxDxV) |
66 x 52 x 29 cm |
Više o BIO-RAD QX200™ AutoDG™ Droplet Digital™ PCR System